Marvel vs. Capcom: Clash of Super Heroes vereint gefeierte Kämpfer aus dem Marvel-Universum und Capcoms vertrautem Aufgebot in rasanten 2D-Tag-Team-Kämpfen. Die Spieler wählen zwei Kämpfer und eine Assist-Figur und stürzen sich dann in schnelle Arcade-Matches.
Das Spiel führt das Variable System ein, mit dem die Spieler im laufenden Kampf nahtlos zwischen den Kämpfern wechseln können. Zur Auswahl stehen 15 spielbare Charaktere, darunter Ryu, Chun-Li, Spider-Man und Captain America, sowie geheime Kämpfer wie Onslaught.
Zu den Markenzeichen gehört Variable Cross, eine Funktion, die es beiden Charakteren erlaubt, für kurze Zeit gleichzeitig anzugreifen. Auf PlayStation bietet das Spiel außerdem exklusive Modi wie Cross Over und Training, die den Spielern mehr Möglichkeiten geben, zu üben und ihre Taktik zu verfeinern.
Bekannt für seine enorme Geschwindigkeit und den markanten Grafikstil, trug dieser Teil dazu bei, das Tag-Team-Kampf-Format zu prägen. Außerdem fordert er die Hardware stark, was zu kurzen Verlangsamungen führen kann, wenn der Bildschirm mit dichten Partikeleffekten gefüllt ist.