En Mi Villano Favorito: El Juego – Caos de Minions, los jugadores toman el control de la fuerza laboral de Minions de Gru. El objetivo es guiar a estos ayudantes amarillos a través de escenarios de laboratorio y suburbanos para apoyar los últimos planes de Gru.
La jugabilidad gira en torno a mecánicas basadas en Minions, que requieren el uso estratégico de diferentes tipos de Minions para superar obstáculos ambientales. Los jugadores asignan tareas y coordinan movimientos para resolver acertijos en varios niveles.
El juego incluye minijuegos y desafíos que aprovechan el lápiz táctil de Nintendo DS para una interacción directa. Los jugadores manipulan objetos y despejan caminos para avanzar a través de las etapas de la historia.