Sundan si piloto Vallen Brice sa MechAssault: Phantom War habang lumalaban siya laban sa Word of Blake, at nagsasagawa ng mga misyon upang makuha ang mahahalagang target sa iba’t ibang planetaryong lugar, sa tulong ng iba’t ibang mabibigat na yunit ng labanan.
Nagdaragdag ang laro ng mga kontrol sa touch-screen na nagbibigay-daan sa mga manlalaro na pamahalaan ang masalimuot na mga sistema ng sandata, makapasok sa mga security terminal, at magsagawa ng mga espesyal na aksyon habang mabilis ang labanan.
Kabilang sa mga tampok nito ang malawak na hanay ng mga mech na puwedeng i-customize, na bawat isa ay may magkakaibang halaga ng bilis, baluti, at lakas ng putok, pati na rin ang mga kapaligirang ganap na nasisira na nagbabago sa larangan ng labanan sa real time.
Isang mahalagang tampok ng MechAssault: Phantom War ang pag-aangkop nito ng console-style na labanan ng prangkisa para sa portable na NDS, gamit ang dual-screen na ayos upang ihiwalay ang taktikal na impormasyon sa pangunahing tanaw ng labanan.