Nakasentro ang Quake II kay Bitterman, isang marine na ipinadala sa Operation Alien Overlord. Ang misyon niya ay pasukin ang homeworld ng mga Strogg, wasakin ang communications hub, at pabagsakin si Makron.
Sa PlayStation, dinaragdagan ang laro ng split-screen cooperative play at deathmatch modes. Binabago nito ang orihinal na mga stage sa PC tungo sa mga segmented map upang umangkop sa limitasyon ng hardware ng system habang nananatiling buo ang hanay ng mga sandata.
Nag-aalok ang combat system ng arsenal na kinabibilangan ng Blaster, Shotgun, at Railgun. Dumaraan ang mga manlalaro sa mga biomechanical na industrial zone, nangongolekta ng health at armor habang tinatahak nila ang masalimuot na mga level na parang maze.
Naalala ang port bilang isang teknikal na tagumpay sa console hardware, na gumamit ng custom lighting at binagong engine upang mapanatili ang performance sa kabila ng limitadong memorya ng system.