Si Stocke, isang ahente na naglilingkod sa kaharian ng Alistel, ay nagkakaroon ng akses sa White Chronicle, isang makapangyarihang relikya na nagbibigay-daan sa paglalakbay sa iba’t ibang alternatibong timeline. Kailangang bumalik ang mga manlalaro sa mahahalagang sandali sa kasaysayan upang baguhin ang mga pangyayari at pigilan ang kontinente na tuluyang maging disyerto.
Nagaganap ang labanan sa ibabaw ng grid at nakatuon sa taktikal na pagpoposisyon. Maaaring itulak ng mga manlalaro ang mga kaaway sa isang 3x3 na battlefield upang pagsama-samahin sila, mas mapalaki ang pinsala gamit ang mga attack na may area of effect, at makabuo ng mahahabang combo chain sa pamamagitan ng magkakaugnay na pag-atake ng partido.
Inilalahad ang kuwento sa pamamagitan ng mapang batay sa mga node na sumusubaybay sa pag-usad sa dalawang magkahiwalay na realidad. Maaaring makaapekto ang bawat desisyon kung mabubuhay o mamamatay ang mahahalagang tauhan, mababago ang sitwasyong pampulitika, at matutukoy kung paano tuluyang magtatapos ang mas malawak na tunggalian.
Pinagdurugtong ng Radiant Historia ang masalimuot na mga sistema ng paglalakbay sa oras at isang kuwentong pampolitika na may maraming patong. Itinatampok din nito ang Nintendo DS sa pamamagitan ng natatanging character art at antas ng estratehikong lalim na bihira noon sa mga handheld role-playing game.