Dans Godzilla: Domination!, les joueurs choisissent parmi des kaiju emblématiques tels que Godzilla, Mothra et King Ghidorah pour affronter des monstres rivaux et semer la destruction dans des environnements urbains.
Le jeu propose six monstres jouables et huit niveaux différents. Le combat comprend des attaques de base, des mouvements spéciaux uniques et des interactions environnementales comme lancer des débris ou démolir des bâtiments pour récolter des power-ups.
Un mode campagne permet de débloquer des personnages et des niveaux supplémentaires. Le gameplay se concentre sur des combats rapides dans des cartes urbaines isométriques compactes conçues pour le jeu portable.
Connu pour ses graphismes détaillés en sprites, le jeu parvient à transmettre l'échelle des monstres géants sur GBA, bien qu'il soit freiné par un comportement IA répétitif et un roster de personnages limité.