Shinseiki Odysselya II mengikuti sekelompok pahlawan saat mereka menjelajahi dunia penuh warna bergaya anime. Pemain memimpin party ini melewati berbagai lokasi, sambil terlibat dalam pertarungan taktis yang mendorong kisahnya terus maju.
Entri ini menambahkan sistem pertarungan yang lebih rumit, di mana susunan party dan kemampuan unik tiap karakter memegang peran besar dalam meraih kemenangan. Pertarungan berlangsung di atas grid, jadi penempatan posisi yang cermat sama pentingnya dengan memilih perintah dalam sistem turn-based tradisional.
Shinseiki Odysselya II juga menyertakan struktur peningkatan yang mendalam, yang memungkinkan pemain memperkuat perlengkapan dan menaikkan statistik party. Petualangan berlangsung di peta dunia yang dipenuhi kota, dungeon, dan sesekali pertemuan tersembunyi.
Dikenang karena penyajian visualnya yang berani di SNES, Shinseiki Odysselya II mendorong kemampuan perangkat kerasnya dengan sprite yang sangat detail dan animasi yang hidup, meskipun antarmuka yang berfokus pada menu kadang dapat memperlambat tempo permainan.