Pemain mengambil peranan sebagai wira terpilih yang mesti menghalang dunia daripada dipadamkan. Matlamatnya ialah menulis semula realiti melalui Book of Prophecy, dengan menentukan bahagian mana dalam persekitaran yang dibawa ke kitaran seterusnya.
Avalon Code berfokus pada Sistem Kod asli yang membolehkan pemain mengimbas musuh dan objek, kemudian menukar sifat elemennya. Dengan mengubah sifat-sifat itu, permainan ini mengubah prestasi pertempuran serta hasil banyak teka-teki sepanjang perjalanan.
Pertempuran menggunakan aksi masa nyata, manakala stylus kekal penting untuk bergerak melalui Book of Prophecy. Pemain perlu kerap berinteraksi dengannya semasa meneroka untuk memastikan data dikemas kini dan untuk mengurus sintesis item.
Avalon Code menonjol dengan konsepnya yang berani, gaya visual yang mudah diingati, dan antara muka stylus yang rumit. Reka bentuknya menuntut perhatian berterusan terhadap pemboleh ubah dalaman permainan, menjadikan pengurusan sebagai sebahagian tetap daripada permainan.