In Kingdom Hearts Re:coded leiden spelers Data-Sora door gesimuleerde versies van klassieke Disney-werelden om de bron te ontdekken van een mysterieuze, corrupte boodschap die verborgen zit in het dagboek van Jiminy Cricket.
Het Stat Matrix-systeem biedt diepgaande personage-aanpassing via een bord in rastervorm, waarmee spelers gezondheid, kracht en vaardigheidsprogressie kunnen bijstellen. De game combineert uiteenlopende speelstijlen en schakelt tussen actie-RPG-gevechten, side-scrolling platformsecties en rail-shootingfragmenten.
Het deck-systeem maakt tactisch gebruik van speciale commando's mogelijk die na gebruik weer opladen. Spelers beheren deze decks om krachtige afmakers en combo-aanvallen los te laten tijdens gevechten tegen Heartless en eindbazen.
Opvallend vanwege zijn technische veelzijdigheid op de Nintendo DS past deze titel meerdere genremechanieken aan de hardware van een handheld aan, en vermengt daarbij effectief actie- en puzzel-elementen binnen het verhalende kader van de serie.