Em Meu Malvado Favorito: O Jogo – Caos dos Minions, os jogadores assumem o controle da força de trabalho de Minions do Gru. O objetivo é guiar esses ajudantes amarelos por cenários de laboratório e subúrbio para apoiar os planos mais recentes do Gru.
A jogabilidade gira em torno de mecânicas baseadas nos Minions, exigindo o uso estratégico de diferentes tipos de Minions para superar obstáculos ambientais. Os jogadores atribuem tarefas e coordenam movimentos para resolver quebra-cabeças em vários níveis.
O jogo inclui minijogos e desafios que aproveitam a stylus do Nintendo DS para interação direta. Os jogadores manipulam objetos e limpam caminhos para avançar pelas fases da história.