Người chơi vào vai một anh hùng được lựa chọn, người phải ngăn một thế giới bị xóa sổ. Mục tiêu là viết lại thực tại thông qua Sách Tiên Tri, quyết định những phần nào của môi trường sẽ được đưa sang chu kỳ tiếp theo.
Avalon Code xoay quanh một Hệ Thống Mã độc đáo cho phép người chơi quét kẻ địch và đồ vật, rồi trao đổi các thuộc tính nguyên tố của chúng. Khi thay đổi những đặc tính đó, trò chơi làm biến đổi cả hiệu quả chiến đấu lẫn kết quả của nhiều câu đố trên đường đi.
Các trận chiến diễn ra theo dạng hành động thời gian thực, còn bút cảm ứng vẫn là công cụ thiết yếu để di chuyển trong Sách Tiên Tri. Người chơi phải thường xuyên tương tác với nó trong lúc khám phá để giữ dữ liệu được cập nhật và xử lý việc tổng hợp vật phẩm.
Avalon Code nổi bật nhờ ý tưởng táo bạo, phong cách hình ảnh đáng nhớ và giao diện điều khiển bằng bút cảm ứng đầy phức tạp. Thiết kế của nó đòi hỏi phải liên tục chú ý đến các biến số nội bộ của trò chơi, khiến việc quản lý trở thành một phần thường trực của trải nghiệm.