Người chơi vào vai một học viên của học viện phép thuật, lên đường qua nhiều thế giới khác nhau để giải cứu các bạn cùng lớp đã bị bắt cóc sau một cuộc tấn công kỳ lạ nhằm vào ngôi trường.
Hệ thống chiến đấu của game tập trung vào sự tương tác giữa các nguyên tố, với các Mana Spirits giúp tăng cường năng lực của từng nhân vật và định hình kết quả của những trận đánh theo lượt thông qua việc kiểm soát cẩn thận các thuộc tính nguyên tố.
Magical Vacation mang phong cách đầy màu sắc, như mơ, cùng một bản đồ thế giới rộng lớn, khuyến khích người chơi khám phá khi cả nhóm băng qua các chiều không gian để truy tìm Enigma.
Do Brownie Brown phát triển, trò chơi nổi bật với đồ họa pixel chi tiết và những hệ thống phép thuật phức tạp, dù bản phát hành gốc của nó chỉ dành riêng cho Nhật Bản.