В Fire Emblem: Mystery of the Emblem игроки следуют за Мартом, изгнанным принцем Альтеи, который командует армией, чтобы вернуть свою родину и сразиться с темными силами, угрожающими миру. Геймплей основан на пошаговых картах и выполнении условий победы — таких как захват тронов или уничтожение вражеских командиров — при сохранении ключевых юнитов.
Эта часть развивает тактическую основу серии, добавляя механику спешивания для конных юнитов, заставляя кавалерию и рыцарей сражаться в пешем строю в помещениях. В состав входят многочисленные рекрутируемые персонажи с уникальными темпами роста, классами и стратегическими ролями, влияющими на их эффективность на поле боя.
Игра разделена на две части: ремейк оригинальной Fire Emblem и прямое продолжение, Mystery of the Emblem, которое продолжает основной сюжет. Игроки управляют инвентарем, оптимизируют рост юнитов и используют бонусы местности для получения преимуществ в сложных стратегических битвах в разнообразных условиях.
Как знаковая игра на Super Famicom, Fire Emblem: Mystery of the Emblem отличается заметными улучшениями графики и интерфейса по сравнению с предшественником. Она укрепила репутацию серии за высокие ставки, постоянную смерть юнитов и глубокий, сюжетно-ориентированный тактический геймплей.